IN SILICO ANALYSIS OF THE Dof TRANSCRIPTION FACTOR FAMILY IN Coffea canephora

  • Vinícius Garcia
  • Alessandra Ferreira Ribas
  • Luiz Gonzaga Esteves Vieira
  • Tiago Benedito dos Santos UNOESTE

Resumo

A família Dof (DNA-binding with One Finger) é um grupo de fatores de transcrição que desempenham papéis importantes no crescimento, desenvolvimento e na resposta das plantas aos estresses bióticos e abióticos. Os genes Dof foram identificados e caracterizados em várias espécies de plantas; entretanto até o presente momento não há informações sobre esses genes em café. No presente estudo foram identificados 24 membros da família Dof no genoma de C. canephora depositados no banco de dados Coffee Genome Hub. Análises sistemáticas de bioinformática foram realizadas para caracterizar os genes Dof em C. canephora, incluindo a análise de sequências genômicas, domínios proteicos conservados, localizações subcelulares, relações filogenéticas e perfis de expressão gênica em diferentes tecidos. Os resultados obtidos fornecem uma melhor compreensão sobre a família dos genes Dof permitindo projetar experimentos futuros para caracterização molecular desses genes no cafeeiro.

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Publicado
2019-02-22
Como Citar
Garcia, V., Ribas, A. F., Vieira, L. G. E., & Santos, T. B. dos. (2019). IN SILICO ANALYSIS OF THE Dof TRANSCRIPTION FACTOR FAMILY IN Coffea canephora. Colloquium Agrariae. ISSN: 1809-8215, 14(4), 99-111. Recuperado de http://revistas.unoeste.br/index.php/ca/article/view/2708

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